DETAILS品牌介紹

Advanced Cell Diagnostics

Advanced Cell Diagnostics, Inc (ACD, California) 創立於2006年美國加州矽谷中心,作為新興的分子病理診斷的領導者,開發以細胞和組織檢測的RNAscope®專利技術和定量平台,並致力於個體化醫療的應用當中。RNAscope®的專利探針技術提供了mRNA單細胞單分子偵測的原位雜交定量分析技術,同時提高靈敏度、降低背景雜訊、且大大縮短時間,(一天即可完成),是原位雜交領域上重大的突破之一,並為藥物研發以及生命科學研究提供了快速、靈敏、方便的工具。

產品詳細介紹Product Introduction

RNAscope®可見光試劑盒
 

RNAscope®以及BaseScope™ assay kit 產品介紹

RNAscope®以及BaseScope™ assay kit是由Advanced Cell Diagnostics (ACD)-BioTechne中所研發的新一代RNA原位雜交(RNA in situ)技術,利用獨特專利雙ZZ探針設計以及特殊信號放大方法確保檢測的高敏感度和特異性。此方法相較於傳統的ISH技術,除了大量縮短實驗時間之外(一天即可完成),更能有效偵測檢體中微量的mRNA分子,使單個RNA分子於組織或細胞上顯現為一個單一的點,將目標mRNA的視覺化,得到定性、定量的結果數據。


RNAscope®以及BaseScope™ assay kit可用於偵測不同mRNA片段大小。RNAscope®針對大於300 bases的mRNA或LncRNA標的;BaseScope™則是針對50到300bases的mRNA,例如:Exon junction splice variant、Circular RNA、SnoRNA、Pre miRNA、以及Gene KO。產品實驗應用範圍廣,相關文獻發表超過數千篇。目前包含萬種以上的目標探針且應用於超過140種以上的物種,其中包含人類、小鼠、大鼠、兔子、犬類、斑馬魚、禽類、靈長類、豬、牛等。此外,同時提供客製化探針服務,僅需兩周即可針對特定序列設計出所需之探針。
 

※實驗流程簡單,類似IHC操作流程,且無須RNAse free環境,輕鬆完成實驗。

 

RNAscope®可見光試劑盒
RNAscope®可見光試劑盒適用於多種檢體類別,包括:懸浮或貼附細胞、新鮮冷凍(Fresh frozen)切片、新鮮固定(Fixed frozen)或福馬林固定石蠟包埋組織中(FFPET)的mRNA和長鏈非編碼RNA (LncRNA)。針對目標mRNA或LncRNA長度約300 bases – 1Kb bases設計約20對double ZZ探針,其中三對結合於目標mRNA即可於視野下呈現一個點狀訊號。

RNAscope®可見光試劑盒分為單染與雙染試劑盒:
RNAscope®單染試劑盒
產品名稱 規格 貨號
RNAscope® 2.5 HD Assay – BROWN 20assay 322300
RNAscope® 2.5 HD Assay – RED 20assay 322350

 



RNAscope®雙染試劑盒
產品名稱 規格 貨號
RNAscope® 2.5 HD Duplex Reagent Kit 20assay 322430
 RNAscope®螢光試劑盒
 

  二代  
 
RNAscope®螢光試劑盒  




RNAscope® Multiplex Fluorescent v2

(貨號:323100)


二代RNAscope® 螢光劑試盒除了適用於懸浮或貼附細胞、與冷凍切片檢體 (Fresh frozen or fixed frozen tissue)之外,更可用於偵測低表現的mRNA以及石蠟包埋的檢體。可於同一個檢體上同時偵測三個(最多四個)以上的mRNA標的。此外結合原本Advanced Cell Diagnostics雙ZZ探針技術以及TSA技術,可更有效偵測低表現的mRNA或mRNA降解較嚴重的檢體上,以及克服自體螢光所造成的影響。

 

RNAscope®螢光試劑盒

 
 
產品名稱 規格 貨號
RNAscope® Fluorescent Multiplex Assay 20assay 320850
RNAscope® Multiplex Fluorescent v2 20assay 323100


 
 

BaseScope™ 試劑盒

BaseScope™試劑盒適用於多種檢體類別,包括:懸浮或貼附細胞、新鮮冷凍(Fresh frozen)切片、新鮮固定(Fixed frozen)或福馬林固定石蠟包埋組織中(FFPET)的mRNA,應用範圍包括:Exon junction splice variant、Circular RNA、SnoRNA、Pre miRNA、以及Gene KO。針對目標mRNA長度約50至300 bases 設計1到6對ZZ探針,其中任一對結合於目標mRNA即可於視野下呈現一個點狀訊號。

BaseScopeTM試劑盒

 
BaseScopeTM試劑盒分為單染與雙染試劑盒:


BaseScopeTM單染試劑盒
產品名稱 規格 貨號
BaseScope™ Reagent Kit v2 – RED 20assay 323900

BaseScopeTM染雙染試劑盒
產品名稱 規格 貨號
RNAscope® 2.5 HD Duplex Reagent Kit 20assay 323800



 
 

RNAscope®與BaseScope™產品比較


    


 

CRISPR-mediated nucleotide deletion and BaseScope™ probe design. (A) CRISPR/Cas9-mediated gene editing was used to delete 49 nts from a wild-type (WT) gene, resulting in a novel junction sequence labeled “Edited”. (B) BaseScope™ paired oligo (1 ZZ) probes were designed to target either the 49 nts in the WT sequence or the Edited novel junction sequence.

Discern cell type-specific gene editing with the BaseScope™ Duplex Assay. CRISPR-mediated gene editing was detected in hepatocytes but not in the central vein (CV) using BaseScope™ Duplex probes for the WT (green) or Edited (red) sequences.



 

miRNAscopeTM試劑盒

miRNAscopeTM試劑盒產品介紹

microRNA是由Advanced Cell Diagnostics (ACD)-BioTechne所研發針對miRNA等小型RNA的RNA原位雜交(RNA in situ)技術
和常見分析miRNA的小型RNA定序(small RNA sequencing)、Microarray及定量即時聚合酶鏈鎖反應(qPCR)相比,miRNAscope TM提供高靈敏度、專一性的單細胞分子偵測檢測分式,檢測包括miRNA在內的小型RNA分子在組織及細胞中的表現。


miRNAscope試劑盒適用於多種檢體類別,包括:懸浮或貼附細胞、新鮮冷凍(Fresh frozen)切片、新鮮固定(Fixed frozen)或福馬林固定石蠟包埋組織中(FFPE)的小型RNA,應用範圍包括:Antisense oligonucleotides (ASOs), microRNAs (miRNAs), Small interfering RNAs (siRNAs),和其他長度介於17-50bases的小型RNA。針對目標設計探針,其中任一對結合於目標mRNA即可於視野下呈現點狀訊號。

miRNAscope™試劑盒單染試劑盒:
產品名稱 規格 貨號
miRNAscope™ HD Reagent Kit- RED 20assay 24500
圖片範例

miRNAscope™ assay used to detect miR-214-3p in different species samples including the mouse brain, rat brain, human brain, and mouse liver. miR-214-3p was successfully detected in the mouse, rat, and human brain tissue samples and not in the negative control mouse liver tissue sample.

miRNAscope™ assay used to specifically detect miR-138-5p in Purkinje cells in cerebellum and hippocampus regions of the mouse brain.
 
 
miRNAscope™ HD assay used to detect the outer nuclear layer (ONL) specific microRNA-182 in FFPE mouse eye sample. Negligible microRNA-182 is also detected in the inner nuclear layer and the ganglion cell layer.

 
 
DNAscope™
 
DNAscopeTM試劑盒
目前檢測 DNA 異常主要使用螢光原位雜交技術(FISH) ,但由於此技術是利用螢光進行染色,因此形態學細節方面資訊不夠全面,並且需要使用高解析度的螢光顯微鏡來觀察基因重排(gene rearrangement)和拷貝數變異(copy number variation)。 此外,細菌人工染色體 (BAC) 的DNA探針長度較長且跨越多個基因,缺乏單基因檢測的特異性,因而限制了DNA研究的發展。
為了克服這些限制,ACD公司推出一種新的可見光DNA 原位雜交技術: DNAscopeTM。此技術採用了RNAscopeTM的雙Z探針設計和訊號放大系統,能夠針對任何DNA目標快速靈活地設計探針,進而在石蠟包埋組織中觀察目標DNA的異常狀況。

DNAscopeTM可見光雙染試劑盒:

DNAscope™雙染有DNAscope™ HD Duplex Reagent Kit(貨號324700)

實驗流程-


探針設計策略-
  • 偵測DNA COPY NUMBER VARIATION


 
  • 偵測DNA BREAK-APART EVENTS



優勢-



產品資訊-
產品名稱 產品描述 貨號
DNAscope™ HD Duplex Reagent Kit 
  • Contains  DNAscope™ HD Duplex Detection-  Reagents
  • DNAscope  Pretreatment  Reagents Kit
  • 50x wash buffer
324700
CONTROL PROBES  
GENE NAME PROBE NAME CATALOG NUMBER
CEP3q DS-Hs-CEP3q-C2 1080211-C2
CEP7q DS-Hs-CEP7q-C2 1080221-C2
CEP9p DS-Hs-CEP9p-C2 1080231-C2
CEP12p DS-Hs-CEP12p-C2 1080241-C2
CEP17q DS-Hs-CEP17q-C2 1080251-C2

TARGET PROBES  
GENE NAME PROBE NAME CATALOG NUMBER
ERBB2 (HER2) DS-Hs-ERBB2-C1 1080031-C1
EGFR DS-Hs-EGFR-C1 1080041-C1
MET DS-Hs-MET-C1 1080051-C1
TP53 DS-Hs-TP53-C1 1080061-C1
CDKN2A DS-Hs-CDKN2A-C1 1080071-C1
ALK DS-Hs-ALK-BA5-C1 1080081-C1
ALK DS-Hs-ALK-BA3-C2 1080091-C2
ROS1 DS-Hs-ROS1-BA5-C1 1080101-C1
ROS1 DS-Hs-ROS1-BA3-C2 1080111-C2
NTRK1 DS-Hs-NTRK1-BA5-C1 1080151-C1
NTRK1 DS-Hs-NTRK1-BA3-C2 1080161-C2
NTRK2 DS-Hs-NTRK2-BA5-C1 1080171-C1
NTRK2 DS-Hs-NTRK2-BA3-C2 1080181-C2
NTRK3 DS-Hs-NTRK3-BA5-C1 1080191-C1
NTRK3 DS-Hs-NTRK3-BA3-C2 1080201-C2
 
RNA-Protein Co-detection Ancillary Kit
RNA-Protein Co-detection Ancillary Kit
同時偵測RNA及Protein的選擇

ACD新推出的Co-detection Ancillary Kit可以搭配RNAscope RED、BaseScope RED & RNAscope Multiplex Fluorescent v2 Kit使用。與先前ISH-IHC建議流程不同,過去先進行Protease的步驟可能會影響抗體抗原結合位,限制了部分抗體的使用。而新的實驗流程提前了抗體抗原反應的步驟,使抗體抗原結合位不受Protease影響,因此可以應用在更多IHC驗證過的抗體上。使研究人員可以在同一組織切片中同時得到RNA及Protein的資訊。

Co-detection Ancillary Kit包含了Target Retrieval Reagents、Antibody Diluent & Blocker。其中Antibody Diluent和其他抗體稀釋液相比,在搭配RNAscope RED & BaseScope RED時可以最好的保留RNA的訊號。

- 實 驗 流 程 -

 
應用-
結合RNA和蛋白質,研究人員可以:
  • 同時偵測病原體和宿主細胞標記
  • 偵測目標細胞中的非編碼RNA (non-coding RNA)
  • 確定分泌蛋白的細胞來源
  • 可觀察細胞邊緣和目標RNA
  • 研究RNA與蛋白質的關聯性
  • 驗證抗體專一性
     
產品資訊-
產品名稱 產品描述 貨號
RNA-Protein Co-detection Ancillary Kit
• Co-detection Blocker
• Co-detection Antibody Diluent
• Co-detection Target Retrieval Reagents (10X)
323180

可搭配Kit-
  • RNAscope Multiplex Fluorescent v2 Assay
  • RNAscope 2.5 HD RED Assay
  • BaseScope v2 RED Assay
Co-detection of mRNA and protein using RNAscope ISH and IF

 (A) FOXP3 protein visualized with PPIB mRNA.
 (B) Ki67 protein visualized with PPOLAR2A, PPIB and UBC mRNA

Co-detection of mRNA and protein using RNAscope ISH and IHC


Detection of protein markers in combination with PPIB mRNA using the RNAscope Red assay with brown chromogen



Detection of protein markers in combination with PPIB mRNA using the RNAscope Red assay with green chromogen
 
RNAscope™ Plus smRNA-RNA HD Reagents Kit
RNAscope™ Plus smRNA-RNA HD Reagents Kit

小片段調控性RNAs(small regulatory RNAs)包括miRNA,參與了人類健康及疾病的調控。獨特的寡核苷酸基因療法,包含了反義寡核苷酸(Antisense Oligonucleotides, ASO)和RNA干擾(RNA interference, RNAi),利用類似於細胞內小片段調控性RNAs的作用機制提供高度集中、持久的治療效果。
 
Advanced Cell Diagnostics miRNAscope ISH技術已成為定位細胞內源性miRNA和測量臨床前動物模型系統中治療性寡核苷酸運送效率的標準方法。現在推出RNAscope Plus smRNA-RNA檢測,結合專利的RNAscope和miRNAscope ISH技術,可做為量化的新工具,應用於處理調控性RNAs後量化基因表現和細胞功能的變化,有助於優化治療效果和安全性。

-
 實 驗 流 程 -

 
優勢-
  • 同時偵測1個小片段RNA以及3個目標mRNA
  • 可以觀察ASO、miRNA、siRNA和其他長度為17-50 nt的小片段RNA以及3個目標RNA
  • 觀察基因調控機制的同時亦保留組織型態學的資訊
  • 驗證完整組織中的miRNA生物標誌物
  • 評估小片段RNA治療運送機制
  • 評估治療藥物的生物分佈和療效
  • 為異質性組織的生物學研究增加視覺化的分析角度
  • 結合ACD專利訊號放大系統和TSA™(Tyramide signal amplification)訊號放大技術
 
產品資訊-
產品名稱 產品描述 貨號
RNAscope™ Plus smRNA-RNA HD Reagents Kit
  • RNAscope™ Plus smRNA-RNA HD Detection Kit
  • RNAscope Multiplex TSA Buffer
  • RNAscope™ Wash Buffer Reagents
  • RNAscope™ H2O2 and Protease Reagents
322785


 
siRNA mediated gene regulation of mRNA target in mouse liver tissue using the manual RNAscope Plus assay.



Specificity of RNAscope™ Plus smRNA-RNA staining. 4-plex smRNA-RNA assay using 1 miRNA (miR-124) specific to brain and 3 mRNAs (POLAR2A, PPIB, UBC).